تنص قواعد الخيمياء على أنه لا بد من خسارة شيء ذي قيمة مساوية للحصول على شيء ما. الخيمياء هي عملية تفكيك وإعادة تركيب جسم ما إلى كيان مختلف، وتخضع هذه العملية لقواعد الخيمياء. ومع ذلك، يوجد شيء قادر على الارتقاء بأي خيميائي فوق هذه القواعد، وهو حجر الفلاسفة. إدوارد إلريك الشاب خيميائي موهوب بشكل خاص، فقد أخاه الأصغر ألفونس وإحدى ساقيه في حادث قبل سنوات. ضحى إدوارد بإحدى ذراعيه أيضًا، واستخدم الخيمياء لربط روح أخيه بدرع. أدى ذلك إلى بداية رحلتهما لاستعادة جسديهما، بحثًا عن حجر الفلاسفة الأسطوري.